L’Evolution liée à l’identification génétique
D’autres types de techniques, alternatives aux techniques utilisant les STR actuels commencent à apparaître sur le marché comme celle utilisant les SNPs.
Les SNPs
Les SNPs (ou Single Nucleotide Polymorphism) sont des polymorphismes de séquence qui se mettent en évidence par la variation d’un seul nucléotide. Par exemple, les deux séquences ADN de deux individus, AAGCCTA et AAGCTTA auront pour seule différence le nucléotide en cinquième position C ou T. Pour ces individus, il n’y a alors que deux allèles possibles C ou T et trois génotypes CC, CT ou TT (allèles des deux chromosomes).
Le polymorphisme des SNPs est donc très limité. Cet inconvénient peut être compensé par le nombre de SNPs analysés. L’analyse de 30 à 50 SNPs pourra ainsi permettre d’obtenir un pouvoir de discrimination proche de celui obtenu avec 13 STR. L’inconvénient majeur des SNPs reste de rendre impossible la détection de mélange. Dans le cas de l’analyse des STR en multiplex, un mélange se détecte facilement par l’apparition d’un 3ème ou 4ème pic correspondant à un 3ème ou un 4ème allèle. Dans le cas des SNPs, il ne peut y avoir que deux allèles et le mélange devient impossible à détecter.
Malgré cela l’analyse des SNPs offre de nombreux avantages et ouvre la voie à de nouvelles applications :
• Leur utilisation permet l’emploi d’amorces de petite taille qui vont permettre d’obtenir des profils exploitables dans des cas où les analyses par STR ne seraient pas concluantes. Si on prend l’exemple d’un ADN très dégradé, les STR de 50 ou 100 nucléotides ont beaucoup plus de possibilités d’être fragmentés et donc le profil ADN inexploitable alors que des SNPs permettraient d’obtenir un profil génétique exploitable. De plus, même après l’utilisation de la PCR les produits d’amplification garderaient l’avantage d’être d’une longueur inférieure à 100 nucléotides.
• Le séquençage complet de l’ADN humain a ouvert la voie à l’identification de gènes qui déterminent des caractères morphologiques comme la couleur des yeux ou des cheveux. Ces gènes diffèrent par un polymorphisme de séquence. L’analyse des SNPs correspondants permettra donc de connaître certains caractères morphologiques de manière automatisé et en un temps record.
• L’utilisation des SNPs est tout à fait adaptée à l’analyse de l’ADN mitochondrial qui possède un polymorphisme de séquence.
Le passage de l’analyse de STR à l’analyse de SNPs reste soumise à une évolution du FNAEG, qui possède uniquement les données exploitées à partir de kits multiplex de référence (allèles des 15 STR). Les profils génétiques actuellement dans la base ne pourraient donc pas être comparés avec les données d’une analyse par SNP. De plus les kits FTA, utilisés pour établir les profils génétiques des personnes mises en cause, sont détruits après analyse et il est donc impossible de reprendre les analyses pour établir de nouveaux profils génétiques.
Progrès et limites de l’ADN
Dans les années à venir, au vu de l’évolution engendrée par l’ADN ces deux dernières décennies, il est difficile de prédire quelles seront les changements majeurs. Des experts réfléchissent déjà à un fichage plus généralisé dès la naissance, d’autres cherchent à améliorer la détection sur les lieux ou travaillent sur l’amélioration de la rapidité et du cout des analyses. Le potentiel étant énorme voir “effrayant” la sécurisation des données (données anonymes avec code barre, système informatique sécurisé) et leur possibilité d’exploitation, reviendra inlassablement au centre du débat
Pour aller plus loin :
- Vers un portrait robot génétique ?
- Le portrait robot génétique TED x Rennes
- Autorisation de déterminer les caractères morphologiques à partir d’une trace ADN
